臺史所 臺灣日記知識庫
臺灣史研究所以wiki協同創作平台建置「臺灣日記知識庫」，收錄《灌園先生日記》、《水竹居主人日記》、《簡吉獄中日記》、《黃旺成先生日記》及《楊基振日記》、《田健治郎日記》、《呂赫若日記》等日記全文/譯文及研究團隊專業解讀成果。知識庫架構以個別日記主人為核心，以「每日」日記為單元，建置日記原文與譯文等內容與解讀資訊，並連結數位影像，提供全文檢索、進階查詢與時間序列瀏覽等開放服務。本所日記特色典藏，搭配官方的旅券紀錄，可勾勒出各個日記記主周遊海外的旅行印記。
中國大陸各省地方志書目查詢系統
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本館自2004年起開始系統性地徵集整理校史資料，尤以新竹清華建校初期史料為中心延伸，包含歷屆校長、校友及教職員、行政與教學單位，以及梅竹賽、校慶、畢業典禮等校園活動之文獻文物、照片、影像影音資料，並陸續進行校友及資深教授之口述歷史訪談，持續累積、充實校史文獻。
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臺史所 臺灣研究古籍資料庫
本資料庫由中研院臺史所檔案館建置。基於提升日治舊籍使用率，改善圖書典藏品質，臺史所於1999年與國立臺灣圖書館協議合作典藏。由臺史所將「臺灣總督府圖書館」、「南方資料館」及臺灣省圖書館購藏帝大教授藏書，運至中研院典藏、整編與開放閱覽。2004年開始，臺史所陸續將前述歷史文獻史料數位典藏，並建置「臺灣研究古籍資料庫」，於2005年對外開放。讀者可由系統檢索圖書、期刊及圖像。線上目錄全面開放，影像則需申請帳號方可瀏覽。
